Protein–RNA interactions for Protein: P48678

Lmna, Prelamin-A/C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LmnaP48678 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LmnaP48678 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
LmnaP48678 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LmnaP48678 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
LmnaP48678 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LmnaP48678 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LmnaP48678 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LmnaP48678 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
LmnaP48678 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LmnaP48678 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LmnaP48678 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
LmnaP48678 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
LmnaP48678 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
LmnaP48678 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Gm32390-201ENSMUST00000212713 1172 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LmnaP48678 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LmnaP48678 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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