Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VdrP48281 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VdrP48281 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VdrP48281 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VdrP48281 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VdrP48281 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VdrP48281 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
VdrP48281 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VdrP48281 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VdrP48281 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VdrP48281 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VdrP48281 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VdrP48281 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VdrP48281 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VdrP48281 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VdrP48281 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VdrP48281 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
VdrP48281 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VdrP48281 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VdrP48281 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VdrP48281 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
VdrP48281 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VdrP48281 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VdrP48281 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VdrP48281 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VdrP48281 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VdrP48281 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VdrP48281 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VdrP48281 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
VdrP48281 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
VdrP48281 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VdrP48281 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VdrP48281 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VdrP48281 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VdrP48281 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VdrP48281 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VdrP48281 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VdrP48281 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VdrP48281 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VdrP48281 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VdrP48281 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
VdrP48281 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
VdrP48281 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
VdrP48281 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
VdrP48281 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
VdrP48281 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
VdrP48281 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VdrP48281 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VdrP48281 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
VdrP48281 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
VdrP48281 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VdrP48281 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
VdrP48281 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
VdrP48281 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
VdrP48281 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
VdrP48281 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VdrP48281 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VdrP48281 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VdrP48281 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VdrP48281 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
VdrP48281 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
VdrP48281 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VdrP48281 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VdrP48281 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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VdrP48281 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
VdrP48281 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VdrP48281 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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VdrP48281 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VdrP48281 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VdrP48281 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
VdrP48281 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VdrP48281 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VdrP48281 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VdrP48281 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
VdrP48281 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VdrP48281 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VdrP48281 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VdrP48281 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
VdrP48281 4933405E24Rik-201ENSMUST00000131019 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VdrP48281 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VdrP48281 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
VdrP48281 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
VdrP48281 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
VdrP48281 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
VdrP48281 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VdrP48281 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
VdrP48281 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VdrP48281 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VdrP48281 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VdrP48281 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VdrP48281 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
VdrP48281 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VdrP48281 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VdrP48281 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
VdrP48281 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
VdrP48281 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VdrP48281 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
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