Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tnfsf9P41274 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Tnfsf9P41274 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Tnfsf9P41274 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tnfsf9P41274 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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