Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mmp9P41245 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mmp9P41245 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mmp9P41245 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mmp9P41245 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mmp9P41245 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mmp9P41245 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mmp9P41245 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mmp9P41245 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mmp9P41245 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mmp9P41245 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mmp9P41245 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mmp9P41245 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Mmp9P41245 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mmp9P41245 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mmp9P41245 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mmp9P41245 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mmp9P41245 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mmp9P41245 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mmp9P41245 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mmp9P41245 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mmp9P41245 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mmp9P41245 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mmp9P41245 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Mmp9P41245 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mmp9P41245 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mmp9P41245 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mmp9P41245 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mmp9P41245 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Mmp9P41245 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mmp9P41245 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mmp9P41245 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mmp9P41245 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mmp9P41245 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Mmp9P41245 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mmp9P41245 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mmp9P41245 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mmp9P41245 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mmp9P41245 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mmp9P41245 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mmp9P41245 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mmp9P41245 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mmp9P41245 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Mmp9P41245 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Mmp9P41245 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Mmp9P41245 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Mmp9P41245 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Mmp9P41245 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Mmp9P41245 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Mmp9P41245 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Mmp9P41245 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Mmp9P41245 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Mmp9P41245 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Mmp9P41245 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Mmp9P41245 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Mmp9P41245 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Mmp9P41245 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Mmp9P41245 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Mmp9P41245 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Mmp9P41245 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Mmp9P41245 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Mmp9P41245 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Mmp9P41245 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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