Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ddit3P35639 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms