Protein–RNA interactions for Protein: P33622

Apoc3, Apolipoprotein C-III, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc3P33622 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Apoc3P33622 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Apoc3P33622 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Apoc3P33622 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Apoc3P33622 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Apoc3P33622 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Apoc3P33622 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Apoc3P33622 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Apoc3P33622 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Apoc3P33622 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Apoc3P33622 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Apoc3P33622 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Apoc3P33622 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Apoc3P33622 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Apoc3P33622 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Apoc3P33622 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Apoc3P33622 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Apoc3P33622 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Apoc3P33622 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Apoc3P33622 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Apoc3P33622 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Apoc3P33622 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Apoc3P33622 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Apoc3P33622 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Apoc3P33622 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Apoc3P33622 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Apoc3P33622 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Apoc3P33622 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Apoc3P33622 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Apoc3P33622 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Apoc3P33622 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Apoc3P33622 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Apoc3P33622 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Apoc3P33622 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Apoc3P33622 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Apoc3P33622 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Apoc3P33622 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Apoc3P33622 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Apoc3P33622 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Apoc3P33622 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Apoc3P33622 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Apoc3P33622 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Apoc3P33622 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Apoc3P33622 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Apoc3P33622 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Apoc3P33622 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Apoc3P33622 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Apoc3P33622 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Apoc3P33622 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Apoc3P33622 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Apoc3P33622 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Apoc3P33622 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Apoc3P33622 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Apoc3P33622 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Apoc3P33622 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Apoc3P33622 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Apoc3P33622 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Apoc3P33622 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Apoc3P33622 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Apoc3P33622 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Apoc3P33622 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Apoc3P33622 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Apoc3P33622 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Apoc3P33622 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Apoc3P33622 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Apoc3P33622 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Apoc3P33622 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Apoc3P33622 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Apoc3P33622 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Apoc3P33622 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoc3P33622 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoc3P33622 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoc3P33622 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoc3P33622 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoc3P33622 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoc3P33622 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoc3P33622 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoc3P33622 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoc3P33622 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoc3P33622 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoc3P33622 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoc3P33622 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoc3P33622 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoc3P33622 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoc3P33622 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoc3P33622 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoc3P33622 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoc3P33622 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoc3P33622 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoc3P33622 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoc3P33622 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoc3P33622 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoc3P33622 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoc3P33622 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoc3P33622 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoc3P33622 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoc3P33622 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoc3P33622 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoc3P33622 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Apoc3P33622 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms