Protein–RNA interactions for Protein: P31310

Hoxa10, Homeobox protein Hox-A10, mousemouse

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa10P31310 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Gm20618-202ENSMUST00000177482 1227 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 AC153912.1-201ENSMUST00000217011 724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxa10P31310 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
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