Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gjb1P28230 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gjb1P28230 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.7 ms