Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Psmb9P28076 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms