Protein–RNA interactions for Protein: P23738

Hdc, Histidine decarboxylase, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HdcP23738 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
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HdcP23738 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HdcP23738 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HdcP23738 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HdcP23738 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HdcP23738 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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HdcP23738 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HdcP23738 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HdcP23738 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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HdcP23738 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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HdcP23738 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HdcP23738 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HdcP23738 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HdcP23738 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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HdcP23738 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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HdcP23738 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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HdcP23738 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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HdcP23738 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HdcP23738 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HdcP23738 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HdcP23738 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HdcP23738 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HdcP23738 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HdcP23738 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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HdcP23738 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HdcP23738 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HdcP23738 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HdcP23738 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HdcP23738 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HdcP23738 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HdcP23738 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HdcP23738 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HdcP23738 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HdcP23738 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HdcP23738 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
HdcP23738 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HdcP23738 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HdcP23738 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HdcP23738 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HdcP23738 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HdcP23738 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HdcP23738 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HdcP23738 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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