Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Eif3aP23116 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Eif3aP23116 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Eif3aP23116 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Eif3aP23116 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Eif3aP23116 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Eif3aP23116 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Eif3aP23116 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Eif3aP23116 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Eif3aP23116 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Eif3aP23116 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Eif3aP23116 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Eif3aP23116 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Eif3aP23116 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Eif3aP23116 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Eif3aP23116 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Eif3aP23116 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Eif3aP23116 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Eif3aP23116 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Eif3aP23116 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Eif3aP23116 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Eif3aP23116 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Eif3aP23116 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Eif3aP23116 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Eif3aP23116 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Eif3aP23116 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Eif3aP23116 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Eif3aP23116 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Eif3aP23116 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Eif3aP23116 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Eif3aP23116 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Eif3aP23116 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Eif3aP23116 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Eif3aP23116 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Eif3aP23116 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Eif3aP23116 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Eif3aP23116 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Eif3aP23116 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Eif3aP23116 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Eif3aP23116 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Eif3aP23116 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Eif3aP23116 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Eif3aP23116 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Eif3aP23116 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Eif3aP23116 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Eif3aP23116 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Eif3aP23116 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Eif3aP23116 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Eif3aP23116 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Eif3aP23116 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Eif3aP23116 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Eif3aP23116 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Eif3aP23116 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Eif3aP23116 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Eif3aP23116 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Eif3aP23116 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Eif3aP23116 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Eif3aP23116 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Eif3aP23116 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Eif3aP23116 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Eif3aP23116 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Eif3aP23116 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Eif3aP23116 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Eif3aP23116 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Eif3aP23116 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Eif3aP23116 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Eif3aP23116 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Eif3aP23116 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Eif3aP23116 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Eif3aP23116 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Eif3aP23116 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Eif3aP23116 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Eif3aP23116 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Eif3aP23116 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Eif3aP23116 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Eif3aP23116 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Eif3aP23116 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Eif3aP23116 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Eif3aP23116 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Eif3aP23116 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Eif3aP23116 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Eif3aP23116 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Eif3aP23116 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Eif3aP23116 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Eif3aP23116 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Eif3aP23116 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Eif3aP23116 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Eif3aP23116 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Eif3aP23116 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Eif3aP23116 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Eif3aP23116 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Eif3aP23116 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Eif3aP23116 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Eif3aP23116 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Eif3aP23116 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Eif3aP23116 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Eif3aP23116 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Eif3aP23116 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Eif3aP23116 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Eif3aP23116 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms