Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NefhP19246 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NefhP19246 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NefhP19246 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NefhP19246 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NefhP19246 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NefhP19246 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NefhP19246 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NefhP19246 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NefhP19246 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NefhP19246 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NefhP19246 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NefhP19246 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NefhP19246 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NefhP19246 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NefhP19246 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NefhP19246 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NefhP19246 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NefhP19246 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NefhP19246 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NefhP19246 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NefhP19246 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NefhP19246 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NefhP19246 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NefhP19246 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NefhP19246 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NefhP19246 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NefhP19246 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NefhP19246 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NefhP19246 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NefhP19246 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NefhP19246 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NefhP19246 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NefhP19246 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
NefhP19246 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
NefhP19246 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NefhP19246 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NefhP19246 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NefhP19246 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NefhP19246 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NefhP19246 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NefhP19246 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NefhP19246 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NefhP19246 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
NefhP19246 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NefhP19246 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
NefhP19246 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NefhP19246 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NefhP19246 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NefhP19246 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
NefhP19246 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NefhP19246 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NefhP19246 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NefhP19246 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NefhP19246 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NefhP19246 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NefhP19246 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NefhP19246 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NefhP19246 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NefhP19246 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NefhP19246 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NefhP19246 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NefhP19246 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NefhP19246 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NefhP19246 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NefhP19246 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NefhP19246 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NefhP19246 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NefhP19246 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NefhP19246 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NefhP19246 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NefhP19246 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NefhP19246 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
NefhP19246 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NefhP19246 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NefhP19246 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NefhP19246 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
NefhP19246 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NefhP19246 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NefhP19246 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NefhP19246 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NefhP19246 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NefhP19246 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NefhP19246 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NefhP19246 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NefhP19246 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NefhP19246 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NefhP19246 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NefhP19246 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NefhP19246 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NefhP19246 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NefhP19246 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NefhP19246 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
NefhP19246 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NefhP19246 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NefhP19246 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NefhP19246 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NefhP19246 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NefhP19246 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NefhP19246 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms