Protein–RNA interactions for Protein: P15975

Usp53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, mousemouse

Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp53P15975 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp53P15975 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp53P15975 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp53P15975 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp53P15975 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp53P15975 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp53P15975 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp53P15975 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp53P15975 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp53P15975 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp53P15975 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp53P15975 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp53P15975 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp53P15975 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp53P15975 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp53P15975 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp53P15975 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp53P15975 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp53P15975 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp53P15975 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp53P15975 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp53P15975 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp53P15975 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp53P15975 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp53P15975 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp53P15975 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp53P15975 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp53P15975 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp53P15975 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp53P15975 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp53P15975 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp53P15975 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp53P15975 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp53P15975 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp53P15975 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp53P15975 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp53P15975 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp53P15975 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp53P15975 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp53P15975 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp53P15975 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp53P15975 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp53P15975 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp53P15975 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp53P15975 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp53P15975 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp53P15975 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp53P15975 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp53P15975 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp53P15975 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp53P15975 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp53P15975 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp53P15975 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp53P15975 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp53P15975 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp53P15975 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp53P15975 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp53P15975 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp53P15975 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp53P15975 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp53P15975 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp53P15975 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp53P15975 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp53P15975 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp53P15975 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp53P15975 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp53P15975 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp53P15975 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp53P15975 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp53P15975 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp53P15975 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp53P15975 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp53P15975 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp53P15975 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp53P15975 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp53P15975 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp53P15975 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp53P15975 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp53P15975 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp53P15975 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp53P15975 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp53P15975 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp53P15975 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp53P15975 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp53P15975 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp53P15975 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp53P15975 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp53P15975 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp53P15975 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp53P15975 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp53P15975 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp53P15975 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp53P15975 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp53P15975 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp53P15975 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp53P15975 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp53P15975 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp53P15975 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp53P15975 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp53P15975 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms