Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Hoxd4P10628 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hoxd4P10628 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms