Protein–RNA interactions for Protein: P09021

Hoxa5, Homeobox protein Hox-A5, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa5P09021 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Hoxa5P09021 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms