Protein–RNA interactions for Protein: P08046

Egr1, Early growth response protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Egr1P08046 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Egr1P08046 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Egr1P08046 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Egr1P08046 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Egr1P08046 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Egr1P08046 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Egr1P08046 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Egr1P08046 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Egr1P08046 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Egr1P08046 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Egr1P08046 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Egr1P08046 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Egr1P08046 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Egr1P08046 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Egr1P08046 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Egr1P08046 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Egr1P08046 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Egr1P08046 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Egr1P08046 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Egr1P08046 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Egr1P08046 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Egr1P08046 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Egr1P08046 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Egr1P08046 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Egr1P08046 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Egr1P08046 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Egr1P08046 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Egr1P08046 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Egr1P08046 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Egr1P08046 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Egr1P08046 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Egr1P08046 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Egr1P08046 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Egr1P08046 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Egr1P08046 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Egr1P08046 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Egr1P08046 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Egr1P08046 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Egr1P08046 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Egr1P08046 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Egr1P08046 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Egr1P08046 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Egr1P08046 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Egr1P08046 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Egr1P08046 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Egr1P08046 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Egr1P08046 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Egr1P08046 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Egr1P08046 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Egr1P08046 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Egr1P08046 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Egr1P08046 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Egr1P08046 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Egr1P08046 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Egr1P08046 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Egr1P08046 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Egr1P08046 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Egr1P08046 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Egr1P08046 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Egr1P08046 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Egr1P08046 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Egr1P08046 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Egr1P08046 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Egr1P08046 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Egr1P08046 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Egr1P08046 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Egr1P08046 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Egr1P08046 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Egr1P08046 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Egr1P08046 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Egr1P08046 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Egr1P08046 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Egr1P08046 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Egr1P08046 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Egr1P08046 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Egr1P08046 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Egr1P08046 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Egr1P08046 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Egr1P08046 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Egr1P08046 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Egr1P08046 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Egr1P08046 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Egr1P08046 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Egr1P08046 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Egr1P08046 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Egr1P08046 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Egr1P08046 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Egr1P08046 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Egr1P08046 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Egr1P08046 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Egr1P08046 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Egr1P08046 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Egr1P08046 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Egr1P08046 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Egr1P08046 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Egr1P08046 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Egr1P08046 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Egr1P08046 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Egr1P08046 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Egr1P08046 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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