Protein–RNA interactions for Protein: P04213

T-cell receptor beta chain V region C5 (Fragment), mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04213 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
P04213 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P04213 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
P04213 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
P04213 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
P04213 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
P04213 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P04213 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
P04213 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
P04213 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
P04213 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
P04213 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P04213 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P04213 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P04213 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P04213 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
P04213 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P04213 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P04213 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P04213 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P04213 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P04213 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P04213 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P04213 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P04213 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P04213 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P04213 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P04213 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P04213 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
P04213 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P04213 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P04213 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P04213 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
P04213 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P04213 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P04213 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P04213 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
P04213 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
P04213 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
P04213 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
P04213 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
P04213 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P04213 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P04213 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P04213 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P04213 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P04213 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P04213 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
P04213 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
P04213 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P04213 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
P04213 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P04213 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
P04213 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P04213 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
P04213 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P04213 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
P04213 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P04213 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P04213 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P04213 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P04213 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
P04213 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P04213 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
P04213 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
P04213 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
P04213 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P04213 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
P04213 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
P04213 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P04213 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P04213 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
P04213 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
P04213 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
P04213 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P04213 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
P04213 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
P04213 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
P04213 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P04213 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
P04213 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
P04213 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P04213 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P04213 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P04213 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P04213 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P04213 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P04213 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
P04213 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P04213 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P04213 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P04213 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
P04213 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P04213 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P04213 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P04213 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
P04213 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
P04213 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
P04213 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
P04213 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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