Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

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Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tgfb1P04202 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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