Protein–RNA interactions for Protein: P01748

Ig heavy chain V region 23, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01748 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01748 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01748 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01748 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01748 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01748 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01748 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01748 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01748 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01748 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01748 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01748 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01748 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01748 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01748 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01748 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01748 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01748 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01748 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01748 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01748 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01748 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01748 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01748 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01748 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01748 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01748 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01748 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01748 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01748 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01748 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01748 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01748 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01748 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01748 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01748 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01748 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01748 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01748 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01748 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01748 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
P01748 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01748 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01748 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01748 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01748 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01748 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01748 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01748 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01748 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01748 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01748 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01748 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01748 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01748 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01748 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
P01748 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01748 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01748 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01748 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01748 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01748 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01748 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01748 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P01748 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P01748 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
P01748 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P01748 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P01748 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P01748 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P01748 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P01748 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P01748 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
P01748 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P01748 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
P01748 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
P01748 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
P01748 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P01748 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
P01748 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
P01748 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
P01748 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
P01748 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
P01748 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P01748 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
P01748 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P01748 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P01748 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
P01748 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
P01748 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P01748 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P01748 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P01748 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P01748 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P01748 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P01748 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
P01748 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P01748 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P01748 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P01748 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms