Protein–RNA interactions for Protein: P01648

Ig kappa chain V-V region HP 91A3, mousemouse

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Length 108 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01648 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01648 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01648 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01648 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01648 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01648 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01648 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01648 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01648 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01648 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
P01648 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01648 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01648 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01648 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01648 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01648 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
P01648 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01648 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
P01648 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01648 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
P01648 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
P01648 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01648 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01648 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
P01648 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01648 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01648 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01648 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01648 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
P01648 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01648 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01648 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01648 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01648 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01648 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
P01648 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01648 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
P01648 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01648 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01648 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01648 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01648 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01648 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01648 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01648 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01648 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01648 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01648 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01648 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01648 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01648 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01648 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01648 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01648 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01648 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01648 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01648 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01648 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01648 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01648 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
P01648 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01648 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01648 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01648 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01648 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01648 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01648 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01648 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01648 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01648 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01648 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01648 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01648 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01648 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01648 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
P01648 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01648 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
P01648 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01648 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
P01648 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
P01648 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
P01648 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
P01648 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
P01648 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
P01648 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01648 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01648 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
P01648 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01648 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01648 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
P01648 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01648 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01648 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01648 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01648 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01648 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01648 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01648 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01648 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01648 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
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