Protein–RNA interactions for Protein: O88255

Gm10509, Mszf57 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10509O88255 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm10509O88255 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm10509O88255 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms