Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lnx1O70263 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms