Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Copb2O55029 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Copb2O55029 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Copb2O55029 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Copb2O55029 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Copb2O55029 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Copb2O55029 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Copb2O55029 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Copb2O55029 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Copb2O55029 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Copb2O55029 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Copb2O55029 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Copb2O55029 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Copb2O55029 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Copb2O55029 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Copb2O55029 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Copb2O55029 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Copb2O55029 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Copb2O55029 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Copb2O55029 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Copb2O55029 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Copb2O55029 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Copb2O55029 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Copb2O55029 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Copb2O55029 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Copb2O55029 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Copb2O55029 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Copb2O55029 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Copb2O55029 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Copb2O55029 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Copb2O55029 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Copb2O55029 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Copb2O55029 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Copb2O55029 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Copb2O55029 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Copb2O55029 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Copb2O55029 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Copb2O55029 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Copb2O55029 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Copb2O55029 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Copb2O55029 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Copb2O55029 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Copb2O55029 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Copb2O55029 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Copb2O55029 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Copb2O55029 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Copb2O55029 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Copb2O55029 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Copb2O55029 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Copb2O55029 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Copb2O55029 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Copb2O55029 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Copb2O55029 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Copb2O55029 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Copb2O55029 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Copb2O55029 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Copb2O55029 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Copb2O55029 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Copb2O55029 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Copb2O55029 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Copb2O55029 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Copb2O55029 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Copb2O55029 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Copb2O55029 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Copb2O55029 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Copb2O55029 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms