Protein–RNA interactions for Protein: O54836

Zmat3, Zinc finger matrin-type protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zmat3O54836 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Zmat3O54836 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zmat3O54836 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zmat3O54836 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zmat3O54836 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zmat3O54836 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zmat3O54836 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zmat3O54836 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zmat3O54836 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zmat3O54836 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zmat3O54836 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zmat3O54836 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zmat3O54836 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zmat3O54836 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zmat3O54836 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zmat3O54836 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Zmat3O54836 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zmat3O54836 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Zmat3O54836 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Zmat3O54836 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zmat3O54836 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Zmat3O54836 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zmat3O54836 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zmat3O54836 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zmat3O54836 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zmat3O54836 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zmat3O54836 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zmat3O54836 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zmat3O54836 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Zmat3O54836 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zmat3O54836 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Zmat3O54836 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zmat3O54836 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zmat3O54836 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zmat3O54836 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zmat3O54836 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zmat3O54836 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zmat3O54836 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zmat3O54836 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zmat3O54836 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zmat3O54836 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zmat3O54836 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zmat3O54836 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zmat3O54836 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Zmat3O54836 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Zmat3O54836 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Zmat3O54836 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zmat3O54836 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Zmat3O54836 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zmat3O54836 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zmat3O54836 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Zmat3O54836 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zmat3O54836 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Zmat3O54836 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zmat3O54836 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Zmat3O54836 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zmat3O54836 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Zmat3O54836 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Zmat3O54836 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Zmat3O54836 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zmat3O54836 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zmat3O54836 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zmat3O54836 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Zmat3O54836 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Zmat3O54836 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Zmat3O54836 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zmat3O54836 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Zmat3O54836 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Zmat3O54836 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zmat3O54836 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zmat3O54836 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zmat3O54836 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zmat3O54836 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zmat3O54836 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zmat3O54836 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zmat3O54836 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Zmat3O54836 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zmat3O54836 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zmat3O54836 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zmat3O54836 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zmat3O54836 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zmat3O54836 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zmat3O54836 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zmat3O54836 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zmat3O54836 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zmat3O54836 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zmat3O54836 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zmat3O54836 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zmat3O54836 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zmat3O54836 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zmat3O54836 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Zmat3O54836 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Zmat3O54836 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Zmat3O54836 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Zmat3O54836 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zmat3O54836 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zmat3O54836 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zmat3O54836 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zmat3O54836 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Zmat3O54836 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms