Protein–RNA interactions for Protein: O35474

Edil3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edil3O35474 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Edil3O35474 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Edil3O35474 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Edil3O35474 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Edil3O35474 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Edil3O35474 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Edil3O35474 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Edil3O35474 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Edil3O35474 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Edil3O35474 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Edil3O35474 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Edil3O35474 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Edil3O35474 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Edil3O35474 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Edil3O35474 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Edil3O35474 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Edil3O35474 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Edil3O35474 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Edil3O35474 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Edil3O35474 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Edil3O35474 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Edil3O35474 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Edil3O35474 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Edil3O35474 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Edil3O35474 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Edil3O35474 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Edil3O35474 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Edil3O35474 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Edil3O35474 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Edil3O35474 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Edil3O35474 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Edil3O35474 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Edil3O35474 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Edil3O35474 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Edil3O35474 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Edil3O35474 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Edil3O35474 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Edil3O35474 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Edil3O35474 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Edil3O35474 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Edil3O35474 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Edil3O35474 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Edil3O35474 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Edil3O35474 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Edil3O35474 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Edil3O35474 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Edil3O35474 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Edil3O35474 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Edil3O35474 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Edil3O35474 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Edil3O35474 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Edil3O35474 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Edil3O35474 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Edil3O35474 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Edil3O35474 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Edil3O35474 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Edil3O35474 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Edil3O35474 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Edil3O35474 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Edil3O35474 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Edil3O35474 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Edil3O35474 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Edil3O35474 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Edil3O35474 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Edil3O35474 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Edil3O35474 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Edil3O35474 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Edil3O35474 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Edil3O35474 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Edil3O35474 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Edil3O35474 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Edil3O35474 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Edil3O35474 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Edil3O35474 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Edil3O35474 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Edil3O35474 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Edil3O35474 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Edil3O35474 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Edil3O35474 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Edil3O35474 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Edil3O35474 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Edil3O35474 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Edil3O35474 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Edil3O35474 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Edil3O35474 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Edil3O35474 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Edil3O35474 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Edil3O35474 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Edil3O35474 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Edil3O35474 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Edil3O35474 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Edil3O35474 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Edil3O35474 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Edil3O35474 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Edil3O35474 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Edil3O35474 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Edil3O35474 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Edil3O35474 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Edil3O35474 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Edil3O35474 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms