Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ArxO35085 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ArxO35085 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ArxO35085 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ArxO35085 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ArxO35085 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ArxO35085 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ArxO35085 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ArxO35085 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ArxO35085 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ArxO35085 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ArxO35085 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ArxO35085 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ArxO35085 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ArxO35085 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ArxO35085 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ArxO35085 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ArxO35085 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ArxO35085 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ArxO35085 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ArxO35085 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ArxO35085 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ArxO35085 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ArxO35085 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ArxO35085 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ArxO35085 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ArxO35085 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ArxO35085 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ArxO35085 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ArxO35085 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ArxO35085 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ArxO35085 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ArxO35085 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ArxO35085 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ArxO35085 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ArxO35085 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ArxO35085 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ArxO35085 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ArxO35085 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ArxO35085 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ArxO35085 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ArxO35085 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ArxO35085 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ArxO35085 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ArxO35085 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ArxO35085 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ArxO35085 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ArxO35085 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ArxO35085 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ArxO35085 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ArxO35085 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ArxO35085 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ArxO35085 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ArxO35085 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ArxO35085 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ArxO35085 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ArxO35085 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ArxO35085 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ArxO35085 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ArxO35085 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ArxO35085 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ArxO35085 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ArxO35085 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ArxO35085 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ArxO35085 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ArxO35085 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ArxO35085 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ArxO35085 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ArxO35085 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ArxO35085 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ArxO35085 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ArxO35085 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ArxO35085 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ArxO35085 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ArxO35085 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ArxO35085 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ArxO35085 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ArxO35085 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ArxO35085 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ArxO35085 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ArxO35085 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ArxO35085 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ArxO35085 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ArxO35085 CAAA01216754.1-201ENSMUST00000215882 1836 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ArxO35085 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ArxO35085 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ArxO35085 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ArxO35085 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ArxO35085 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ArxO35085 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ArxO35085 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ArxO35085 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ArxO35085 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ArxO35085 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ArxO35085 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ArxO35085 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ArxO35085 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ArxO35085 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ArxO35085 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ArxO35085 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms