Protein–RNA interactions for Protein: J3QNY8

Gm19965, Predicted gene, 19965, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm19965J3QNY8 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm19965J3QNY8 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm19965J3QNY8 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm19965J3QNY8 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm19965J3QNY8 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm19965J3QNY8 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm19965J3QNY8 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm19965J3QNY8 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm19965J3QNY8 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm19965J3QNY8 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm19965J3QNY8 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm19965J3QNY8 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm19965J3QNY8 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm19965J3QNY8 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm19965J3QNY8 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm19965J3QNY8 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm19965J3QNY8 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm19965J3QNY8 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm19965J3QNY8 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm19965J3QNY8 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm19965J3QNY8 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm19965J3QNY8 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm19965J3QNY8 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm19965J3QNY8 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Gm19965J3QNY8 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm19965J3QNY8 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm19965J3QNY8 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm19965J3QNY8 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm19965J3QNY8 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm19965J3QNY8 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm19965J3QNY8 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm19965J3QNY8 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm19965J3QNY8 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm19965J3QNY8 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm19965J3QNY8 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Gm19965J3QNY8 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm19965J3QNY8 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Gm19965J3QNY8 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Gm19965J3QNY8 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm19965J3QNY8 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm19965J3QNY8 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm19965J3QNY8 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Gm19965J3QNY8 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm19965J3QNY8 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm19965J3QNY8 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Gm19965J3QNY8 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm19965J3QNY8 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Gm19965J3QNY8 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm19965J3QNY8 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Gm19965J3QNY8 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm19965J3QNY8 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Gm19965J3QNY8 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm19965J3QNY8 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm19965J3QNY8 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm19965J3QNY8 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm19965J3QNY8 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm19965J3QNY8 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Gm19965J3QNY8 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm19965J3QNY8 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm19965J3QNY8 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm19965J3QNY8 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm19965J3QNY8 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
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Gm19965J3QNY8 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm19965J3QNY8 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm19965J3QNY8 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm19965J3QNY8 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm19965J3QNY8 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm19965J3QNY8 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm19965J3QNY8 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm19965J3QNY8 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm19965J3QNY8 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm19965J3QNY8 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm19965J3QNY8 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm19965J3QNY8 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm19965J3QNY8 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm19965J3QNY8 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm19965J3QNY8 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm19965J3QNY8 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm19965J3QNY8 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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