Protein–RNA interactions for Protein: G3UY57

Trim15, Tripartite motif protein 15, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim15G3UY57 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim15G3UY57 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Trim15G3UY57 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Trim15G3UY57 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim15G3UY57 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim15G3UY57 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim15G3UY57 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim15G3UY57 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim15G3UY57 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim15G3UY57 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim15G3UY57 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim15G3UY57 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim15G3UY57 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim15G3UY57 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim15G3UY57 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim15G3UY57 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim15G3UY57 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim15G3UY57 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim15G3UY57 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim15G3UY57 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim15G3UY57 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim15G3UY57 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim15G3UY57 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim15G3UY57 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim15G3UY57 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim15G3UY57 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim15G3UY57 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim15G3UY57 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim15G3UY57 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim15G3UY57 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim15G3UY57 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim15G3UY57 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim15G3UY57 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim15G3UY57 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim15G3UY57 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim15G3UY57 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim15G3UY57 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim15G3UY57 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim15G3UY57 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim15G3UY57 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim15G3UY57 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim15G3UY57 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim15G3UY57 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim15G3UY57 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim15G3UY57 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim15G3UY57 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim15G3UY57 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim15G3UY57 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim15G3UY57 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim15G3UY57 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim15G3UY57 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim15G3UY57 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim15G3UY57 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim15G3UY57 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim15G3UY57 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim15G3UY57 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim15G3UY57 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim15G3UY57 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim15G3UY57 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim15G3UY57 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim15G3UY57 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim15G3UY57 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim15G3UY57 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim15G3UY57 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim15G3UY57 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim15G3UY57 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim15G3UY57 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim15G3UY57 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim15G3UY57 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim15G3UY57 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim15G3UY57 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim15G3UY57 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim15G3UY57 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim15G3UY57 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim15G3UY57 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim15G3UY57 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim15G3UY57 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim15G3UY57 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim15G3UY57 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim15G3UY57 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim15G3UY57 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim15G3UY57 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim15G3UY57 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim15G3UY57 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim15G3UY57 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim15G3UY57 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim15G3UY57 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim15G3UY57 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim15G3UY57 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim15G3UY57 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim15G3UY57 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim15G3UY57 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim15G3UY57 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim15G3UY57 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim15G3UY57 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim15G3UY57 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim15G3UY57 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim15G3UY57 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim15G3UY57 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim15G3UY57 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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