Protein–RNA interactions for Protein: F8VQM2

Ccl26, Chemokine (C-C motif) ligand 26, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl26F8VQM2 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl26F8VQM2 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl26F8VQM2 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl26F8VQM2 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl26F8VQM2 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl26F8VQM2 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl26F8VQM2 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl26F8VQM2 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl26F8VQM2 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl26F8VQM2 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl26F8VQM2 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl26F8VQM2 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl26F8VQM2 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl26F8VQM2 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl26F8VQM2 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl26F8VQM2 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl26F8VQM2 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl26F8VQM2 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl26F8VQM2 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl26F8VQM2 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl26F8VQM2 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl26F8VQM2 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl26F8VQM2 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl26F8VQM2 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl26F8VQM2 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl26F8VQM2 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl26F8VQM2 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl26F8VQM2 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl26F8VQM2 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl26F8VQM2 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl26F8VQM2 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl26F8VQM2 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccl26F8VQM2 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl26F8VQM2 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl26F8VQM2 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl26F8VQM2 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl26F8VQM2 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl26F8VQM2 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl26F8VQM2 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl26F8VQM2 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl26F8VQM2 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl26F8VQM2 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl26F8VQM2 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl26F8VQM2 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl26F8VQM2 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl26F8VQM2 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl26F8VQM2 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl26F8VQM2 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl26F8VQM2 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl26F8VQM2 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl26F8VQM2 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl26F8VQM2 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl26F8VQM2 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl26F8VQM2 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl26F8VQM2 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl26F8VQM2 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl26F8VQM2 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl26F8VQM2 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl26F8VQM2 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl26F8VQM2 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl26F8VQM2 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl26F8VQM2 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl26F8VQM2 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl26F8VQM2 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl26F8VQM2 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl26F8VQM2 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl26F8VQM2 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl26F8VQM2 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl26F8VQM2 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccl26F8VQM2 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl26F8VQM2 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl26F8VQM2 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl26F8VQM2 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl26F8VQM2 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl26F8VQM2 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl26F8VQM2 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl26F8VQM2 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl26F8VQM2 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl26F8VQM2 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl26F8VQM2 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl26F8VQM2 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl26F8VQM2 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl26F8VQM2 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl26F8VQM2 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl26F8VQM2 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl26F8VQM2 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl26F8VQM2 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl26F8VQM2 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl26F8VQM2 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl26F8VQM2 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl26F8VQM2 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl26F8VQM2 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl26F8VQM2 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl26F8VQM2 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl26F8VQM2 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl26F8VQM2 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl26F8VQM2 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl26F8VQM2 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl26F8VQM2 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl26F8VQM2 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms