Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
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H2-M1F7CXU4 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
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H2-M1F7CXU4 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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H2-M1F7CXU4 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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H2-M1F7CXU4 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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H2-M1F7CXU4 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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H2-M1F7CXU4 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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H2-M1F7CXU4 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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H2-M1F7CXU4 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
H2-M1F7CXU4 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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H2-M1F7CXU4 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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