Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ddx60E9PZQ1 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ddx60E9PZQ1 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ddx60E9PZQ1 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ddx60E9PZQ1 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ddx60E9PZQ1 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ddx60E9PZQ1 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ddx60E9PZQ1 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ddx60E9PZQ1 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ddx60E9PZQ1 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ddx60E9PZQ1 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ddx60E9PZQ1 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ddx60E9PZQ1 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ddx60E9PZQ1 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ddx60E9PZQ1 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ddx60E9PZQ1 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ddx60E9PZQ1 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ddx60E9PZQ1 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ddx60E9PZQ1 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ddx60E9PZQ1 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ddx60E9PZQ1 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ddx60E9PZQ1 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ddx60E9PZQ1 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ddx60E9PZQ1 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ddx60E9PZQ1 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ddx60E9PZQ1 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ddx60E9PZQ1 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ddx60E9PZQ1 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ddx60E9PZQ1 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ddx60E9PZQ1 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ddx60E9PZQ1 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ddx60E9PZQ1 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ddx60E9PZQ1 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ddx60E9PZQ1 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ddx60E9PZQ1 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ddx60E9PZQ1 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ddx60E9PZQ1 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ddx60E9PZQ1 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ddx60E9PZQ1 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ddx60E9PZQ1 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ddx60E9PZQ1 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ddx60E9PZQ1 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ddx60E9PZQ1 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ddx60E9PZQ1 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ddx60E9PZQ1 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ddx60E9PZQ1 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ddx60E9PZQ1 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ddx60E9PZQ1 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ddx60E9PZQ1 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ddx60E9PZQ1 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ddx60E9PZQ1 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ddx60E9PZQ1 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ddx60E9PZQ1 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ddx60E9PZQ1 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ddx60E9PZQ1 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ddx60E9PZQ1 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ddx60E9PZQ1 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ddx60E9PZQ1 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ddx60E9PZQ1 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ddx60E9PZQ1 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ddx60E9PZQ1 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ddx60E9PZQ1 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ddx60E9PZQ1 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ddx60E9PZQ1 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ddx60E9PZQ1 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ddx60E9PZQ1 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ddx60E9PZQ1 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ddx60E9PZQ1 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ddx60E9PZQ1 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ddx60E9PZQ1 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ddx60E9PZQ1 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ddx60E9PZQ1 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ddx60E9PZQ1 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ddx60E9PZQ1 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ddx60E9PZQ1 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ddx60E9PZQ1 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ddx60E9PZQ1 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ddx60E9PZQ1 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ddx60E9PZQ1 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ddx60E9PZQ1 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ddx60E9PZQ1 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ddx60E9PZQ1 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ddx60E9PZQ1 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ddx60E9PZQ1 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ddx60E9PZQ1 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ddx60E9PZQ1 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ddx60E9PZQ1 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ddx60E9PZQ1 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ddx60E9PZQ1 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ddx60E9PZQ1 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ddx60E9PZQ1 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ddx60E9PZQ1 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ddx60E9PZQ1 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ddx60E9PZQ1 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ddx60E9PZQ1 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ddx60E9PZQ1 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ddx60E9PZQ1 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ddx60E9PZQ1 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ddx60E9PZQ1 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ddx60E9PZQ1 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms