Protein–RNA interactions for Protein: D3Z235

Gm3543, Predicted gene 3543, mousemouse

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Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3543D3Z235 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3543D3Z235 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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