Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cspp1B2RX88 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cspp1B2RX88 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms