Protein–RNA interactions for Protein: B1B0R1

Gm2012, Predicted gene 2012, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2012B1B0R1 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm2012B1B0R1 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm2012B1B0R1 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm2012B1B0R1 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm2012B1B0R1 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm2012B1B0R1 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm2012B1B0R1 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm2012B1B0R1 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm2012B1B0R1 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm2012B1B0R1 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm2012B1B0R1 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm2012B1B0R1 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm2012B1B0R1 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm2012B1B0R1 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm2012B1B0R1 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm2012B1B0R1 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm2012B1B0R1 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm2012B1B0R1 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm2012B1B0R1 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm2012B1B0R1 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm2012B1B0R1 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm2012B1B0R1 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm2012B1B0R1 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm2012B1B0R1 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm2012B1B0R1 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm2012B1B0R1 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm2012B1B0R1 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm2012B1B0R1 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm2012B1B0R1 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm2012B1B0R1 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm2012B1B0R1 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm2012B1B0R1 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm2012B1B0R1 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm2012B1B0R1 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm2012B1B0R1 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm2012B1B0R1 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm2012B1B0R1 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm2012B1B0R1 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm2012B1B0R1 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm2012B1B0R1 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm2012B1B0R1 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm2012B1B0R1 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm2012B1B0R1 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm2012B1B0R1 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm2012B1B0R1 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm2012B1B0R1 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm2012B1B0R1 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm2012B1B0R1 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm2012B1B0R1 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm2012B1B0R1 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm2012B1B0R1 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm2012B1B0R1 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm2012B1B0R1 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm2012B1B0R1 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm2012B1B0R1 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm2012B1B0R1 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm2012B1B0R1 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm2012B1B0R1 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm2012B1B0R1 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm2012B1B0R1 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm2012B1B0R1 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm2012B1B0R1 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm2012B1B0R1 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm2012B1B0R1 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm2012B1B0R1 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm2012B1B0R1 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm2012B1B0R1 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm2012B1B0R1 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm2012B1B0R1 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm2012B1B0R1 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm2012B1B0R1 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm2012B1B0R1 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm2012B1B0R1 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm2012B1B0R1 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm2012B1B0R1 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm2012B1B0R1 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm2012B1B0R1 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm2012B1B0R1 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm2012B1B0R1 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm2012B1B0R1 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm2012B1B0R1 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm2012B1B0R1 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm2012B1B0R1 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm2012B1B0R1 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm2012B1B0R1 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm2012B1B0R1 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm2012B1B0R1 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm2012B1B0R1 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm2012B1B0R1 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm2012B1B0R1 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm2012B1B0R1 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm2012B1B0R1 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm2012B1B0R1 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm2012B1B0R1 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm2012B1B0R1 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm2012B1B0R1 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm2012B1B0R1 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm2012B1B0R1 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm2012B1B0R1 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm2012B1B0R1 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms