Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Atp8b5A3FIN4 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp8b5A3FIN4 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Atp8b5A3FIN4 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Atp8b5A3FIN4 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp8b5A3FIN4 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp8b5A3FIN4 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp8b5A3FIN4 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Atp8b5A3FIN4 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp8b5A3FIN4 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp8b5A3FIN4 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Atp8b5A3FIN4 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp8b5A3FIN4 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp8b5A3FIN4 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp8b5A3FIN4 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp8b5A3FIN4 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp8b5A3FIN4 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp8b5A3FIN4 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp8b5A3FIN4 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp8b5A3FIN4 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp8b5A3FIN4 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp8b5A3FIN4 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp8b5A3FIN4 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp8b5A3FIN4 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms