Protein–RNA interactions for Protein: A2ATD1

Ism1, Isthmin-1, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ism1A2ATD1 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ism1A2ATD1 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ism1A2ATD1 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ism1A2ATD1 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ism1A2ATD1 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ism1A2ATD1 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ism1A2ATD1 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ism1A2ATD1 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ism1A2ATD1 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ism1A2ATD1 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ism1A2ATD1 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ism1A2ATD1 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ism1A2ATD1 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ism1A2ATD1 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ism1A2ATD1 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ism1A2ATD1 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ism1A2ATD1 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ism1A2ATD1 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ism1A2ATD1 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ism1A2ATD1 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ism1A2ATD1 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ism1A2ATD1 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ism1A2ATD1 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ism1A2ATD1 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ism1A2ATD1 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ism1A2ATD1 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ism1A2ATD1 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ism1A2ATD1 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ism1A2ATD1 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ism1A2ATD1 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ism1A2ATD1 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ism1A2ATD1 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ism1A2ATD1 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ism1A2ATD1 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ism1A2ATD1 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ism1A2ATD1 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ism1A2ATD1 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ism1A2ATD1 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ism1A2ATD1 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ism1A2ATD1 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ism1A2ATD1 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ism1A2ATD1 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ism1A2ATD1 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ism1A2ATD1 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ism1A2ATD1 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ism1A2ATD1 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ism1A2ATD1 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ism1A2ATD1 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ism1A2ATD1 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ism1A2ATD1 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ism1A2ATD1 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ism1A2ATD1 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ism1A2ATD1 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ism1A2ATD1 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ism1A2ATD1 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ism1A2ATD1 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ism1A2ATD1 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ism1A2ATD1 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ism1A2ATD1 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ism1A2ATD1 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ism1A2ATD1 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ism1A2ATD1 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ism1A2ATD1 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ism1A2ATD1 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ism1A2ATD1 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ism1A2ATD1 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ism1A2ATD1 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ism1A2ATD1 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ism1A2ATD1 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ism1A2ATD1 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ism1A2ATD1 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ism1A2ATD1 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ism1A2ATD1 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ism1A2ATD1 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ism1A2ATD1 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ism1A2ATD1 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ism1A2ATD1 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ism1A2ATD1 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ism1A2ATD1 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ism1A2ATD1 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ism1A2ATD1 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ism1A2ATD1 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ism1A2ATD1 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ism1A2ATD1 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ism1A2ATD1 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ism1A2ATD1 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ism1A2ATD1 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ism1A2ATD1 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ism1A2ATD1 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ism1A2ATD1 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ism1A2ATD1 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ism1A2ATD1 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ism1A2ATD1 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ism1A2ATD1 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ism1A2ATD1 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ism1A2ATD1 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ism1A2ATD1 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ism1A2ATD1 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ism1A2ATD1 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ism1A2ATD1 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms