Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP6

Gm5538, MCG67716, mousemouse

Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5538W4VSP6 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm5538W4VSP6 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm5538W4VSP6 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms