Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2A0

Pdpk1, 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdpk1Q9Z2A0 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pdpk1Q9Z2A0 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Pdpk1Q9Z2A0 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Pdpk1Q9Z2A0 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Pdpk1Q9Z2A0 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Pdpk1Q9Z2A0 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Pdpk1Q9Z2A0 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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