Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Cldn8Q9Z260 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Cldn8Q9Z260 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn8Q9Z260 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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