Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV27

Atp1a4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1a4Q9WV27 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp1a4Q9WV27 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms