Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

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Length 511 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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