Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLJ0

Litaf, Lipopolysaccharide-induced tumor necrosis factor-alpha factor homolog, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LitafQ9JLJ0 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LitafQ9JLJ0 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LitafQ9JLJ0 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LitafQ9JLJ0 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
LitafQ9JLJ0 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
LitafQ9JLJ0 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
LitafQ9JLJ0 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LitafQ9JLJ0 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LitafQ9JLJ0 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
LitafQ9JLJ0 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
LitafQ9JLJ0 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
LitafQ9JLJ0 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
LitafQ9JLJ0 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
LitafQ9JLJ0 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
LitafQ9JLJ0 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LitafQ9JLJ0 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
LitafQ9JLJ0 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
LitafQ9JLJ0 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
LitafQ9JLJ0 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
LitafQ9JLJ0 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LitafQ9JLJ0 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
LitafQ9JLJ0 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LitafQ9JLJ0 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
LitafQ9JLJ0 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LitafQ9JLJ0 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LitafQ9JLJ0 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LitafQ9JLJ0 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LitafQ9JLJ0 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LitafQ9JLJ0 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
LitafQ9JLJ0 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LitafQ9JLJ0 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LitafQ9JLJ0 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LitafQ9JLJ0 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LitafQ9JLJ0 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
LitafQ9JLJ0 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LitafQ9JLJ0 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LitafQ9JLJ0 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LitafQ9JLJ0 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LitafQ9JLJ0 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
LitafQ9JLJ0 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LitafQ9JLJ0 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LitafQ9JLJ0 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LitafQ9JLJ0 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LitafQ9JLJ0 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LitafQ9JLJ0 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LitafQ9JLJ0 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LitafQ9JLJ0 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LitafQ9JLJ0 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LitafQ9JLJ0 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LitafQ9JLJ0 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LitafQ9JLJ0 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LitafQ9JLJ0 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LitafQ9JLJ0 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LitafQ9JLJ0 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
LitafQ9JLJ0 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LitafQ9JLJ0 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LitafQ9JLJ0 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LitafQ9JLJ0 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LitafQ9JLJ0 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
LitafQ9JLJ0 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
LitafQ9JLJ0 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
LitafQ9JLJ0 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
LitafQ9JLJ0 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
LitafQ9JLJ0 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
LitafQ9JLJ0 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
LitafQ9JLJ0 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.5
LitafQ9JLJ0 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
LitafQ9JLJ0 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
LitafQ9JLJ0 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LitafQ9JLJ0 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LitafQ9JLJ0 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
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LitafQ9JLJ0 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LitafQ9JLJ0 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LitafQ9JLJ0 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
LitafQ9JLJ0 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LitafQ9JLJ0 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LitafQ9JLJ0 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LitafQ9JLJ0 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LitafQ9JLJ0 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LitafQ9JLJ0 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LitafQ9JLJ0 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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LitafQ9JLJ0 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
LitafQ9JLJ0 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
LitafQ9JLJ0 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LitafQ9JLJ0 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
LitafQ9JLJ0 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
LitafQ9JLJ0 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LitafQ9JLJ0 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
LitafQ9JLJ0 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LitafQ9JLJ0 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LitafQ9JLJ0 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LitafQ9JLJ0 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LitafQ9JLJ0 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
LitafQ9JLJ0 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LitafQ9JLJ0 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
LitafQ9JLJ0 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
LitafQ9JLJ0 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
LitafQ9JLJ0 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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