Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pkd2l2Q9JLG4 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pkd2l2Q9JLG4 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms