Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB9

Nectin3, Nectin-3, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin3Q9JLB9 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Nectin3Q9JLB9 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nectin3Q9JLB9 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nectin3Q9JLB9 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nectin3Q9JLB9 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nectin3Q9JLB9 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nectin3Q9JLB9 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nectin3Q9JLB9 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nectin3Q9JLB9 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nectin3Q9JLB9 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nectin3Q9JLB9 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nectin3Q9JLB9 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nectin3Q9JLB9 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nectin3Q9JLB9 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nectin3Q9JLB9 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nectin3Q9JLB9 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nectin3Q9JLB9 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nectin3Q9JLB9 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nectin3Q9JLB9 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nectin3Q9JLB9 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nectin3Q9JLB9 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nectin3Q9JLB9 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nectin3Q9JLB9 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nectin3Q9JLB9 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nectin3Q9JLB9 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nectin3Q9JLB9 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nectin3Q9JLB9 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nectin3Q9JLB9 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nectin3Q9JLB9 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nectin3Q9JLB9 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nectin3Q9JLB9 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nectin3Q9JLB9 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Nectin3Q9JLB9 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nectin3Q9JLB9 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nectin3Q9JLB9 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nectin3Q9JLB9 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Nectin3Q9JLB9 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nectin3Q9JLB9 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nectin3Q9JLB9 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nectin3Q9JLB9 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nectin3Q9JLB9 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nectin3Q9JLB9 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nectin3Q9JLB9 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nectin3Q9JLB9 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nectin3Q9JLB9 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nectin3Q9JLB9 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nectin3Q9JLB9 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nectin3Q9JLB9 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nectin3Q9JLB9 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nectin3Q9JLB9 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nectin3Q9JLB9 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nectin3Q9JLB9 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Nectin3Q9JLB9 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nectin3Q9JLB9 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nectin3Q9JLB9 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nectin3Q9JLB9 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nectin3Q9JLB9 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nectin3Q9JLB9 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nectin3Q9JLB9 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nectin3Q9JLB9 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nectin3Q9JLB9 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nectin3Q9JLB9 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nectin3Q9JLB9 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nectin3Q9JLB9 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nectin3Q9JLB9 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Nectin3Q9JLB9 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nectin3Q9JLB9 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nectin3Q9JLB9 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nectin3Q9JLB9 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nectin3Q9JLB9 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nectin3Q9JLB9 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Nectin3Q9JLB9 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nectin3Q9JLB9 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nectin3Q9JLB9 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nectin3Q9JLB9 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nectin3Q9JLB9 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nectin3Q9JLB9 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nectin3Q9JLB9 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nectin3Q9JLB9 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nectin3Q9JLB9 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nectin3Q9JLB9 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nectin3Q9JLB9 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nectin3Q9JLB9 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nectin3Q9JLB9 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nectin3Q9JLB9 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nectin3Q9JLB9 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nectin3Q9JLB9 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nectin3Q9JLB9 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nectin3Q9JLB9 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nectin3Q9JLB9 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nectin3Q9JLB9 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nectin3Q9JLB9 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nectin3Q9JLB9 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nectin3Q9JLB9 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nectin3Q9JLB9 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nectin3Q9JLB9 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nectin3Q9JLB9 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nectin3Q9JLB9 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nectin3Q9JLB9 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nectin3Q9JLB9 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms