Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ1

Tlr1, Toll-like receptor 1, mousemouse

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Length 795 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr1Q9EPQ1 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Tlr1Q9EPQ1 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Tlr1Q9EPQ1 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tlr1Q9EPQ1 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Tlr1Q9EPQ1 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tlr1Q9EPQ1 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tlr1Q9EPQ1 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tlr1Q9EPQ1 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tlr1Q9EPQ1 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tlr1Q9EPQ1 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tlr1Q9EPQ1 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Tlr1Q9EPQ1 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tlr1Q9EPQ1 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tlr1Q9EPQ1 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tlr1Q9EPQ1 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tlr1Q9EPQ1 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tlr1Q9EPQ1 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tlr1Q9EPQ1 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tlr1Q9EPQ1 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tlr1Q9EPQ1 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tlr1Q9EPQ1 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tlr1Q9EPQ1 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tlr1Q9EPQ1 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tlr1Q9EPQ1 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Tlr1Q9EPQ1 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tlr1Q9EPQ1 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tlr1Q9EPQ1 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tlr1Q9EPQ1 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tlr1Q9EPQ1 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tlr1Q9EPQ1 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Tlr1Q9EPQ1 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tlr1Q9EPQ1 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tlr1Q9EPQ1 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tlr1Q9EPQ1 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Tlr1Q9EPQ1 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tlr1Q9EPQ1 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tlr1Q9EPQ1 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Tlr1Q9EPQ1 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Tlr1Q9EPQ1 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tlr1Q9EPQ1 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tlr1Q9EPQ1 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tlr1Q9EPQ1 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Tlr1Q9EPQ1 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Tlr1Q9EPQ1 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Tlr1Q9EPQ1 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Tlr1Q9EPQ1 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tlr1Q9EPQ1 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tlr1Q9EPQ1 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Tlr1Q9EPQ1 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Tlr1Q9EPQ1 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Tlr1Q9EPQ1 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tlr1Q9EPQ1 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tlr1Q9EPQ1 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tlr1Q9EPQ1 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Tlr1Q9EPQ1 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tlr1Q9EPQ1 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tlr1Q9EPQ1 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tlr1Q9EPQ1 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Tlr1Q9EPQ1 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Tlr1Q9EPQ1 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tlr1Q9EPQ1 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Tlr1Q9EPQ1 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Tlr1Q9EPQ1 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tlr1Q9EPQ1 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tlr1Q9EPQ1 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tlr1Q9EPQ1 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tlr1Q9EPQ1 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tlr1Q9EPQ1 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tlr1Q9EPQ1 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tlr1Q9EPQ1 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tlr1Q9EPQ1 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tlr1Q9EPQ1 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tlr1Q9EPQ1 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tlr1Q9EPQ1 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tlr1Q9EPQ1 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tlr1Q9EPQ1 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tlr1Q9EPQ1 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tlr1Q9EPQ1 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms