Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAA3

Uncharacterized protein C4orf36 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9DAA3 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q9DAA3 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q9DAA3 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q9DAA3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q9DAA3 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q9DAA3 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q9DAA3 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q9DAA3 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q9DAA3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Q9DAA3 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms