Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc89Q9DA73 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc89Q9DA73 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc89Q9DA73 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc89Q9DA73 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc89Q9DA73 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms