Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6F9

Tubb4a, Tubulin beta-4A chain, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4aQ9D6F9 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubb4aQ9D6F9 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms