Protein–RNA interactions for Protein: Q9D479

Uvssa, UV-stimulated scaffold protein A, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UvssaQ9D479 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
UvssaQ9D479 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
UvssaQ9D479 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
UvssaQ9D479 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
UvssaQ9D479 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
UvssaQ9D479 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
UvssaQ9D479 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
UvssaQ9D479 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
UvssaQ9D479 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
UvssaQ9D479 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
UvssaQ9D479 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
UvssaQ9D479 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
UvssaQ9D479 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
UvssaQ9D479 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
UvssaQ9D479 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
UvssaQ9D479 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
UvssaQ9D479 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
UvssaQ9D479 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
UvssaQ9D479 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
UvssaQ9D479 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
UvssaQ9D479 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
UvssaQ9D479 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
UvssaQ9D479 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
UvssaQ9D479 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
UvssaQ9D479 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
UvssaQ9D479 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
UvssaQ9D479 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
UvssaQ9D479 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
UvssaQ9D479 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
UvssaQ9D479 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
UvssaQ9D479 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
UvssaQ9D479 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
UvssaQ9D479 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
UvssaQ9D479 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
UvssaQ9D479 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
UvssaQ9D479 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
UvssaQ9D479 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
UvssaQ9D479 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
UvssaQ9D479 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
UvssaQ9D479 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
UvssaQ9D479 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
UvssaQ9D479 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
UvssaQ9D479 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
UvssaQ9D479 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
UvssaQ9D479 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
UvssaQ9D479 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
UvssaQ9D479 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
UvssaQ9D479 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
UvssaQ9D479 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
UvssaQ9D479 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
UvssaQ9D479 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
UvssaQ9D479 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
UvssaQ9D479 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
UvssaQ9D479 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
UvssaQ9D479 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
UvssaQ9D479 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
UvssaQ9D479 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
UvssaQ9D479 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
UvssaQ9D479 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
UvssaQ9D479 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
UvssaQ9D479 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UvssaQ9D479 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UvssaQ9D479 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UvssaQ9D479 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UvssaQ9D479 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UvssaQ9D479 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UvssaQ9D479 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UvssaQ9D479 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UvssaQ9D479 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UvssaQ9D479 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
UvssaQ9D479 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UvssaQ9D479 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
UvssaQ9D479 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UvssaQ9D479 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UvssaQ9D479 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UvssaQ9D479 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UvssaQ9D479 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UvssaQ9D479 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UvssaQ9D479 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
UvssaQ9D479 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UvssaQ9D479 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UvssaQ9D479 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UvssaQ9D479 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UvssaQ9D479 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UvssaQ9D479 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
UvssaQ9D479 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
UvssaQ9D479 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UvssaQ9D479 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UvssaQ9D479 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UvssaQ9D479 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UvssaQ9D479 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UvssaQ9D479 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UvssaQ9D479 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UvssaQ9D479 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UvssaQ9D479 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UvssaQ9D479 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UvssaQ9D479 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UvssaQ9D479 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UvssaQ9D479 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UvssaQ9D479 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms