Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN4

Shisa9, Protein shisa-9, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa9Q9CZN4 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Shisa9Q9CZN4 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms